Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFIP11Q9UBB9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms