Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms