Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP5Q9NZZ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP5Q9NZZ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms