Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EHD3Q9NZN3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms