Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL6

SIDT1, SID1 transmembrane family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIDT1Q9NXL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SIDT1Q9NXL6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIDT1Q9NXL6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms