Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CWC25Q9NXE8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CWC25Q9NXE8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms