Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCLQ9NW38 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCLQ9NW38 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms