Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASF1BQ9NVP2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms