Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMP3Q9NV31 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMP3Q9NV31 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms