Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM140Q9NV12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms