Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TREX1Q9NSU2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX1Q9NSU2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms