Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOMER3Q9NSC5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms