Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FBXO8Q9NRD0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FBXO8Q9NRD0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms