Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAR1AQ9NR31 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAR1AQ9NR31 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms