Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDF3Q9NR23 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF3Q9NR23 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms