Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC31BQ9NQW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms