Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PNPLA8Q9NP80 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms