Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZCCHC17Q9NP64 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZCCHC17Q9NP64 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms