Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB6Q9NP58 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB6Q9NP58 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB6Q9NP58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB6Q9NP58 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB6Q9NP58 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB6Q9NP58 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB6Q9NP58 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB6Q9NP58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB6Q9NP58 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB6Q9NP58 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB6Q9NP58 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB6Q9NP58 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB6Q9NP58 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms