Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CENPJQ9HC77 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms