Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG4Q9H9E3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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COG4Q9H9E3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COG4Q9H9E3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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COG4Q9H9E3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COG4Q9H9E3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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