Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMYD3Q9H7B4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMYD3Q9H7B4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms