Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCAD1Q9H4L7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCAD1Q9H4L7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms