Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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KCNQ1DNQ9H478 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
KCNQ1DNQ9H478 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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