Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PARLQ9H300 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PARLQ9H300 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PARLQ9H300 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PARLQ9H300 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PARLQ9H300 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PARLQ9H300 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms