Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNMDQ9H2S6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNMDQ9H2S6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms