Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG9Q9H0W8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG9Q9H0W8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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