Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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