Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTR3CQ9C0K3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTR3CQ9C0K3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms