Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM5Q9C035 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM5Q9C035 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms