Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM6Q9C030 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms