Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACSIN1Q9BY11 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACSIN1Q9BY11 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms