Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRRTQ9BXP5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRRTQ9BXP5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms