Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms