Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC106Q9BWC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms