Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC94Q9BW85 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC94Q9BW85 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms