Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM2Q9BVW6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms