Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNPY3Q9BT09 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNPY3Q9BT09 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms