Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAAF1Q9BRP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAAF1Q9BRP4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms