Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AGPAT1Q99943 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT1Q99943 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms