Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYD88Q99836 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYD88Q99836 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms