Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT12Q99456 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT12Q99456 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms