Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5RAP2Q96SN8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK5RAP2Q96SN8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms