Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPXM1Q96SM3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPXM1Q96SM3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms