Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALS2CR12Q96Q35 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms