Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC115Q96NT0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms