Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EP400Q96L91 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms