Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUSD3Q96L08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUSD3Q96L08 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms