Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPGRIP1Q96KN7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms