Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
PRAC1Q96KF2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms